Diferença entre Exome e Transcriptome | Exome vs Transcriptome

Diferença-chave - Exome vs Transcriptome

Um gene contém regiões codificantes e não codificantes dentro dela. As sequências de codificação são conhecidas como exões, e as sequências não codificantes são conhecidas como intrões. A sequência de nucleótidos dos exões de um gene representa o código genético do gene para sintetizar a proteína específica. Assim, os exões permanecem na molécula do mRNA. A região do exão total do genoma é conhecida como exoma, e é uma parte importante do genoma. O código genético dos genes é convertido no código genético da molécula de mRNA, que é necessário para a produção de proteínas. As moléculas inteiras de mRNA transcritas em uma célula ou uma população de células ao mesmo tempo são conhecidas como transcriptome. A principal diferença entre exome e transcriptome é que

exome representa as seqüências das regiões do exão do genoma enquanto transcriptome representa o mRNA total de uma célula ou um tecido em um determinado momento.

ÍNDICE

1. Visão geral e diferença de chave

2. O que é Exome

3. O que é Transcriptome

4. Comparação lado a lado - Exome vs Transcriptome

5. Resumo

O que é o Exome?

Os genes são compostos de exões, intrões e seqüências reguladoras. Os exões são as regiões de genes que são transcritas na sequência de mRNA durante a transcrição. Introns e outras regiões que não codificam são removidas durante a transcrição. A sequência de nucleótidos dos exões determina o código genético do gene que sintetiza a proteína específica que codifica. Somente os exões permanecem dentro do mRNA de uma proteína. A coleção de exões no genoma é conhecida como exoma de um organismo. Representa uma parte do genoma que é expressa em genes. Nos seres humanos, exoma conta 1% do genoma. É a porção codificadora de proteínas do genoma humano.

Figura 01: Exome

O que é transcriptoma?

O transcriptome é a coleção de todos os transcritos de codificação de proteínas e não codificantes (ARNs) em um determinado tecido. O transcriptoma representa a coleção de moléculas de mRNA totais expressas pelos genes em uma célula ou tecido. O transcriptome de uma célula pode ser variado com o transcriptome de outro tipo de célula. O transcriptome também é dinâmico - ele muda com o tempo em resposta a estímulos internos e externos. Mesmo dentro do mesmo tecido ou dentro do mesmo tipo de célula, o transcriptome pode mudar após alguns minutos.

O transcriptome difere do exoma de um organismo. Transcriptoma inclui apenas as seqüências de exoma expressas.Embora o exoma de uma célula permaneça o mesmo, o transcriptome difere entre as células, uma vez que a expressão gênica não é a mesma para todas as células ou tecidos. Somente genes essenciais são expressos em diferentes células e tecidos. A expressão genética é um processo específico do tipo de tecido ou célula. É regulado por vários fatores, incluindo fatores ambientais. Portanto, o transcriptoma pode variar com as condições ambientais externas.

O transcriptoma é usado como um precursor para estudos de proteômica. Todas as proteínas são derivadas de sequências de mRNA. As modificações de tradução podem resultar em mudanças nas proteínas. No entanto, o transcriptoma fornece informações básicas importantes para os estudos proteômicos.

Figura 02: Transcriptome de células-tronco embrionárias

Qual a diferença entre Exome e Transcriptome?

- diff Artigo Médio antes da Tabela ->

Exome versus Transcriptome

Exome é a coleção de região codificadora de proteína dos genes.
O transcriptoma é a coleção de todos os ARN transcritos, incluindo mRNA.	Amostra
Exome é estudado usando amostra de DNA.
O transcriptome é estudado usando uma amostra de ARN.	Método de Estudo
Toda a sequência de exomas é o método de estudo do exoma.
A seqüência de ARN é o método de estudo do transcriptome.	Resumo - Exome vs Transcriptome

Os exões são as seqüências de codificação dos genes e determinam as seqüências de mRNA das proteínas. A coleção dessas seqüências de codificação (exões) é conhecida como exoma de um organismo. Os genes são transcritos em moléculas de ARNm antes de produzir proteínas. As moléculas de ARNm totais de uma célula ou um tecido em qualquer momento são conhecidas como transcriptome. Transcriptome representa os genes que estão sendo ativamente expressos em mRNA em qualquer momento. O transcriptoma é específico de células e tecidos e afeta as condições ambientais. Esta é a diferença entre exome e transcriptome.

Referências:

1. Sarah et al., "Captação direta e seqüenciamento massivamente paralelo de 12 exomes humanos. "Natureza. U. S. Biblioteca Nacional de Medicina, 10 de setembro de 2009. Web. 01 de abril de 2017

2. Mutz et al. "Análise de transcriptoma usando sequenciação da próxima geração. "Elsevier: Article Locator. N. p., Em setembro de 2012. Web. 01 Abr. 2017

Cortesia da imagem:

1. "O transcriptome das células pluripotentes" Por Grskovic, M. e Ramalho-Santos, M., O transcriptome pluripotente (10 de outubro de 2008), StemBook, ed. The Stem Cell Research Community, StemBook, doi / 10. 3824 / stembook. 1. 24. 1, // www. stembook. org. - [1] DirectStemBook Figura 2 O transcriptome de células pluripotentes. Grskovic, M. e Ramalho-Santos, M., The transcriptome pluripotente (10 de outubro de 2008), StemBook, ed. The Stem Cell Research Community, StemBook, doi / 10. 3824 / stembook. 1. 24. 1, (CC BY 3. 0) via Commons Wikimedia