Diferença Entre siRNA e shRNA | shRNA vs siRNA

shRNA vs siRNA

Durante o processo de interferência de RNA (RNAi), a expressão de um gene alvo é derrubada com alta especificidade e seletividade. RNAi é um processo natural, e envolve ARN de interferência pequeno (siRNA) e ARN de cabelo curto (shRNA) e shRNA bi-funcional. Atualmente, o RNAi é amplamente utilizado como uma ferramenta para terapia personalizada contra o câncer. As aplicações de RNAi são basicamente feitas com as moléculas de ARNs de siRNA de cadeia dupla quimicamente sintetizadas e baseadas em vetor. Embora essas duas moléculas tenham resultados funcionais semelhantes, elas diferem em sua estrutura; Assim, os mecanismos moleculares de ação, as vias de RNA e os efeitos fora do alvo dessas duas moléculas também diferem.

shRNA

shRNA é uma seqüência de molécula de RNA pequena que faz uma curva de hairpin apertada que pode ser usada para silenciar uma expressão de gene alvo durante RNAi. A expressão de shRNA é conseguida por um vetor, que pode ser um vírus ou uma bactéria ou por entrega de plasmídeos. Eles são sintetizados no núcleo das células e transportados para o citoplasma para outros processos. Essas moléculas possuem caminhos de maturação semelhantes de miARN; assim, a síntese de miARN forneceu a base para a compreensão da síntese de shRNA. Tanto a ARN polimerase II como III podem transcrever shRNA através de promotores de ARN polimerase II ou III. A vantagem do uso de shRNAs é que eles têm uma taxa de degradação e volume de negócios relativamente baixas. A desvantagem é que ele precisa de um vetor de expressão, o que pode causar alguns problemas de segurança.

siRNA

siRNAs são moléculas de ARN de cadeia dupla compostas de 20 a 25 pares de bases de comprimento. Estes são usados ​​para a supressão de genes silenciando qualquer gene com sequência de nucleótidos complementar na via RNAi. O knockdown de genes por transfecção de siRNA é muitas vezes mal sucedido devido ao efeito transitório; especialmente em células que se dividem rapidamente e a supressão não dura mais. Para superar esta questão, o siRNA é modificado pela introdução de uma estrutura de hairpin curta. Esta molécula modificada, então conhecida como shRNA. O shRNA deve ser convertido em siRNA por um Dicer para continuar sua função normal.

Qual a diferença entre shRNA e siRNA?

• Ao contrário do siRNA, o shRNA possui uma estrutura de hairpin extra. O shRNA é uma versão modificada do siRNA.

• shRNA requer um vetor de expressão, enquanto o siRNA não.

• shRNA pode ser usado para o knockdown a longo prazo, enquanto o siRNA pode ser usado apenas para o knockdown de curto prazo de genes.

• Ao contrário da supressão de genes de siRNA, a supressão de shRNA é duradoura e, se for inserida através de um vetor viral apropriado, pode produzir efeitos permanentes de silenciamento de genes.

• Dicer é necessário para converter o shRNA de volta para siRNA molécula para executar suas funções normais.