Diferença entre VNTR e STR | VNTR vs STR

Diferença-chave - VNTR vs STR

Os estudos de DNA têm imensa utilidade na compreensão e determinação de relações filogenéticas, diagnóstico de doenças genéticas e mapeamento de genomas do organismo. Várias técnicas associadas à análise de DNA são usadas para a identificação de um gene específico ou uma sequência de DNA em um grupo de DNA desconhecido. Eles são conhecidos como marcadores genéticos. Os marcadores genéticos são utilizados na biologia molecular para identificar a variação genética entre indivíduos e espécies. O número variável de repetição em tandem (VNTR) e a repetição em tandem curto (STR) são dois tipos de marcadores genéticos que mostram polimorfismo entre indivíduos. Ambos os tipos são DNA repetitivo não codificado que são repetições em tandem. Eles estão dispostos em uma forma de cabeça para cauda em cromossomos. VNTR é uma seção do genoma onde a sequência de nucleotídeos curta é repetida várias vezes. STR é outra seção de DNA dentro do genoma que é organizada como unidades repetitivas consistindo de dois a treze nucleótidos em cem vezes. A diferença de chave entre VNTR e STR é o número de nucleótidos em uma sequência repetida. As unidades repetitivas de VNTR consistem em 10 a 100 nucleótidos, enquanto a unidade de repetição de STR consiste de 2 a 13 nucleótidos . VNTR e STR são amplamente utilizados em estudos forenses.

ÍNDICE

1. Visão geral e diferença de chave

2. O que é VNTR

3. O que é STR

4. Semelhanças entre VNTR e STR

5. Comparação lado a lado - VNTR vs STR na forma tabular

6. Resumo

O que é VNTR?

Uma repetição em tandem é uma pequena seqüência de DNA que é repetida na forma de cabeça para cauda em um locus cromossômico específico. Não há outra sequência ou nucleótido dentro da repetição em tandem. Existem vários tipos de repetições em tandem no genoma. O VNTR é um tipo de repetição em tandem entre eles, que possui unidades repetitivas que consistem em 10 a 100 nucleótidos. O VNTR é um tipo de minisatellite. Estas repetições em tandem podem ser encontradas em muitos cromossomos. Eles são intercalados dentro do genoma humano e estão situados predominantemente nas regiões subteloméricas dos cromossomos.

Os VNTRs apresentam polimorfismo repetido em tandem entre indivíduos. O comprimento do VNTR em uma localização particular do cromossomo é altamente variável entre os indivíduos devido à variação no número de unidades repetitivas organizadas naquela seção de DNA. Portanto, o VNTR pode ser usado como uma ferramenta poderosa na identificação de indivíduos e a análise de VNTR é utilizada em vários campos, incluindo genética, pesquisa de biologia, forense e impressão digital de DNA.Os VNTRs foram os primeiros marcadores genéticos utilizados para quantificar o enxerto de transplante de medula óssea. Os VNTRs também foram os primeiros marcadores polimórficos utilizados no perfil de DNA em forenses.

Figura 01: Variação de VNTRs em seis indivíduos

A análise VNTR é realizada por meio de polimorfismo de comprimento de restrição seguido de hibridação do sul. Por isso, é necessário comparativamente uma grande amostra de DNA. A interpretação do perfil VNTR também é problemática. Devido a estas limitações, o uso de VNTR na genética forense tem sido limitado e é substituído por análise de STR.

O que é STR?

STR é uma seção de DNA altamente repetitiva que consiste em duas a treze unidades de repetição de nucleotídeos organizadas em tandem. O STR é semelhante ao VNTR. Mas varia de VNTR do número de nucleotídeos em uma seqüência repetitiva e o número de repetições. STR é um tipo de microsatélite.

Análise STR envolvida na medição do número exato de unidades repetidas. Os STRs são altamente variáveis entre os indivíduos, semelhantes aos VNTs. Os perfis STR diferem de pessoa para pessoa. Portanto, a análise de STR é utilizada na biologia molecular para comparar loci específicos em DNA de duas ou mais amostras. Por isso, STRs são considerados marcadores genéticos poderosos na biologia molecular. Ele fornece uma excelente ferramenta para identificação de indivíduos devido ao alto grau de polimorfismo e comprimento relativamente curto.

Atualmente, os STR são a ferramenta de polimorfismo genético analisado mais comumente usado na genética forense. A maioria dos casos forenses envolvem análise polimórfica STR. Os loci STR são espalhados por todo o genoma. Existem milhares de STRs localizados em cromossomos que podem ser usados na análise forense. A análise de STR não envolve o polimorfismo de comprimento de restrição, como a análise de VNTR. A análise de STR não corta o DNA com enzimas de restrição. Sondas específicas são usadas para unir regiões desejadas no DNA e usando a técnica de PCR, os comprimentos do STR são determinados.

Figura 02: Variação STR entre amostras

Quais são as semelhanças entre VNTR e STR?

VNTR e STR são DNA não codificado.
Ambos são repetições em tandem.
Ambos mostram polimorfismo entre indivíduos devido à diferença no comprimento da seção de DNA.
Ambos são usados como marcadores genéticos poderosos na impressão de dedos de DNA e em estudos forenses.

Qual a diferença entre VNTR e STR?

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VNTR vs STR
O VNTR é um DNA repetitivo não codificado que possui uma sequência de nucleotídeos curta repetida em tandem.	STR é uma seção de DNA altamente repetitiva que consiste em duas a treze unidades de repetição de nucleotídeos organizadas em tandem.
Tamanho
Os VNTRs são maiores do que STRs.	STRs são menores que os VNTRs.
Número de nucleótidos na seqüência de repetição
A unidade de repetição de VNTR consiste em 10 a 100 nucleótidos.	A unidade de repetição de STR consiste em 2 a 13 nucleótidos.

Resumo - VNTR vs STR

VNTR e STR são dois marcadores genéticos poderosos utilizados na biologia molecular, especialmente no campo da genética forense.VNTR é um tipo de minisatellite e STR é um microsatélite. VNTR e STR são não codificantes, DNA altamente repetitivo. São repetições em tandem. A estrutura geral de VNTR e STR é a mesma. No entanto, o número de nucleótidos na sequência repetitiva e o comprimento são diferentes. O VNTR tem sequências repetitivas consistindo de 10 a 100 nucleótidos. STR tem sequências repetitivas consistindo de 2 a 13 nucleótidos. Esta é a diferença entre VNTR e STR.

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Referências:

1. "A Ciência da Genética Forense. "CRG - Conselho de Genética Responsável. N. p., n. d. Rede. Disponivel aqui. 10 de julho de 2017.

2. "Análise de STR". "Wikipedia. Wikimedia Foundation, 22 de março de 2017. Web. Disponivel aqui. 10 de julho de 2017.

Cortesia da imagem:

1. "D1S80Demo" Por PaleWhaleGail na Wikipedia em inglês (CC BY-SA 3. 0) via Commons Wikimedia