Diferença entre cDNA e Genomic Library | cDNA vs Genomic DNA Library
Diferença-chave - cDNA vs biblioteca genômica
Existem dois grandes tipos de bibliotecas de DNA construídas por cientistas usando técnicas de engenharia genética. Esses são biblioteca cDNA e biblioteca Genomic. A diferença de chave entre cDNA e biblioteca Genomic é que a biblioteca de cDNA contém o DNA complementar clonado de mRNA total de um organismo, enquanto a biblioteca de DNA genômico contém os fragmentos clonados de todo o genoma de um organismo. A biblioteca de DNA genômico é maior do que a biblioteca de cDNA.
ÍNDICE
1. Visão geral e diferença de chave
2. O que é cDNA Library
3. O que é Genomic Library
4. Comparação lado a lado - cDNA vs biblioteca genômica
5. Resumo
O que é uma Biblioteca Genômica?
Uma biblioteca de DNA genômico é uma coleção de clones com os fragmentos de DNA genômico total de um organismo. Contém todo o DNA genômico desse organismo, incluindo seqüências codificantes e não codificantes. A construção de uma biblioteca genômica é realizada pela tecnologia de DNA recombinante seguida de clonagem (engenharia genética). Existem diferentes etapas envolvidas na construção, como mostrado na figura 01. O processo começa com o isolamento de DNA genômico. Utilizando um protocolo adequado de extração de DNA, o DNA genômico total de um organismo deve ser isolado. Em seguida, o DNA deve ser convertido em tamanhos gerenciáveis ou nos fragmentos específicos por endonucleases de restrição (enzimas de corte de DNA). O DNA fragmentado deve ser inserido em vetores usando ligases de DNA (DNA juntando enzimas). Um vetor é um organismo auto-replicante. Os plasmídeos e os bacteriófagos são vetores comummente usados na tecnologia de DNA recombinante. Estes vetores ligados são conhecidos como moléculas de DNA recombinante, uma vez que eles carregam sequências de DNA próprias e inseridas. Os vetores recombinantes são adicionados a uma bactéria hospedeira e feitos para absorver os vetores recombinantes dentro da célula bacteriana. As bactérias com vectores recombinantes (plasmídeos) devem ser cultivadas num meio de cultura. Durante a multiplicação bacteriana, o DNA bacteriano, juntamente com plasmídeos recombinantes, replica seus genomas e produz clones. Esses clones contêm todo o genoma do organismo de origem. Por isso, é chamado de biblioteca genômica. Os plasmídeos podem ser facilmente separados do DNA cromossômico bacteriano para construir a biblioteca genômica desse organismo. Se um organismo específico contém genes interessados, é fácil detectá-lo na biblioteca genômica por hibridação usando sondas moleculares (marcadores).
As bibliotecas genômicas são importantes para estudar a estrutura e função genômica, genes específicos, localização de genes, mapeamento de genes, mutações, seqüenciamento de genes, identificação de novos genes terapêuticos, etc.
Figura_1: Construção de um biblioteca genômica
O que é uma biblioteca de cDNA?
Uma biblioteca de cADN é uma coleção de clones de ADN complementar (cDNA) sintetizados a partir de mRNA total de um organismo. O procedimento de construção envolve diferentes passos. A purificação do mRNA total de um organismo é o primeiro passo envolvido. O mRNA isolado é convertido em cadeias de cDNA por um processo chamado transcrição reversa. A transcrição reversa é facilitada por uma enzima chamada transcriptase reversa. Ele usa um pequeno iniciador 3 'e inicia a síntese da primeira cadeia de cDNA complementar à cadeia mRNA de modelo. O cDNA de cadeia dupla resultante é convertido em fragmentos menores usando endonucleases de restrição e inserido em vetores adequados. Estas moléculas recombinantes construídas são então adicionadas a um organismo hospedeiro e crescidas num meio de cultura para produzir clones. A coleção de clones contendo fragmentos de cDNA de um organismo é conhecida como uma biblioteca de cDNA. O mRNA maduro em fatias totalmente não contém intrões e regiões reguladoras. Portanto, fragmentos não codificantes não estão presentes em bibliotecas de cDNA ao contrário de uma biblioteca genômica.
bibliotecas de cDNA são importantes para a análise de regiões de codificação, funções de genes, expressão de genes, etc.
Figura_2: Construção de uma biblioteca de cDNA
Qual a diferença entre cDNA e Genomic Library?
- Dif do artigo Médio antes da Tabela ->
cDNA vs Genomic Library |
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| biblioteca de cDNA é uma coleção de clones com o DNA complementar ao mRNA de um organismo | A biblioteca genômica é uma coleção dos clones que carregam o DNA genômico total de um organismo. |
| Coding vs Noncoding Sequences | |
| biblioteca de cDNA contém apenas as seqüências de codificação; não contém intrões. | A biblioteca genômica consiste em todo o DNA genômico, incluindo o DNA não codificado (intrão e regulatório). |
| Tamanho | |
| biblioteca de cDNA é pequena. | A biblioteca genômica é grande. |
| Material de partida | |
| O material de partida é mRNA | O material de partida é o DNA. |
| Envolvimento da transcrição reversa. | |
| A transcrição reversa ocorre na primeira síntese da cadeia de cDNA. | A transcrição reversa não acontece. |
Resumo - cDNA and Genomic Library
A biblioteca genômica representa uma população de clones com o DNA genômico total fragmentado de um organismo. A biblioteca de cDNA representa a população de clones com DNA complementar do mRNA total de um organismo. Um clone de cDNA contém apenas as sequências encontradas no mRNA enquanto o clone genômico contém as sequências de todo o genoma. Esta é a diferença entre cDNA e biblioteca genômica.
Referência:
1. Haneef, Deena T KochunniJazir. "Diferença entre Genomic e cDNA Library. "Diferença entre Genomic e cDNA Library. N. p., n. d. Rede. 15 de fevereiro2017
2. Stekel, Dov J., Yoav Git e Francesco Falciani. "A comparação da expressão gênica de múltiplas bibliotecas de cDNA. "Genome Research. Cold Spring Harbor Laboratory Press, dezembro de 2000. Web. 16 de fevereiro de 2017
3. "Telas de biblioteca genômica para genes envolvidos na tolerância ao n-butanol em Escherichia coli. "Telas de biblioteca genômica para genes envolvidos na tolerância ao n-butanol em Escherichia coli. N. p., n. d. Rede. 16 de fevereiro de 2017
Cortesia da imagem:
1. "Formação de uma biblioteca de cDNA" Por PhD Dre na Wikipédia em inglês (CC BY-SA 3. 0) via Commons Wikimedia
2. "Construção da Biblioteca Genômica" Por Aluquette - Trabalho próprio (CC BY-SA 3. 0) via Commons Wikimedia
